Aos órgãos complementares competem atividades de caráter permanente de apoio, necessárias ao desenvolvimento do ensino, da pesquisa e da extensão. São eles:

• Biblioteca Central (BCE)
• Secretaria de Tecnologia da Informação (STI)
• Editora Universidade de Brasília (EDU)
• Fazenda Água Limpa (FAL)
• Hospital Universitário (HUB)
• Rádio e Televisão Universitárias (UnBTV)
• Arquivo Central (ACE)
• Parque Científico e Tecnológico (PCTec)
• Centro de Educação a Distância e Tecnologias Educacionais (CEAD)

Os órgãos auxiliares da reitoria são o Gabinete (GRE), a Prefeitura (PRC), a Secretaria de Infraestrutura (Infra), a Secretaria de Meio Ambiente (Sema) e a Secretaria de Patrimônio Imobiliário (SPI).